Eva Milheiro é docente e investigadora no Instituto Politécnico de Portalegre desde 2000, onde presidiu à Área Científica de História, Geografia e Património, coordenou o Departamento de Ciências Sociais, Território e Desenvolvimento e presidiu ao Conselho Pedagógico. Foi coordenadora da Licenciatura em Turismo e da Pós Graduação em Enoturismo. Atualmente, coordena a Pós Graduação em Olivoturismo. Tem estado envolvida em vários projetos de investigação nacionais e internacionais relacionados com o desenvolvimento sustentável de áreas periféricas.